1940年，学校增设中等机械技术科或中等电机技术科（学校两科均设）。中技科招收初中毕业、年龄在16-20周岁的男青年入学，在校学习三年，工厂实习一年，全免学费。学校从1940年10月起开始招收中技科学生，以后每年均招收新生。中技科对课堂教学和实习实验均有严格要求，这对学校是一大考验。学校除努力修复原被毁机器、电机外，千方百计购置新添各种实习设备。根据1941年校庆留下的照片看到，学校当时除车床、交流马达外，还有短波发报机、交换机、收音机、煮纸罐等，基本能保证学生实习正常开展。
1944年，教育部又要求学校增办航空机械技术科。学校因此将机技科二、三年级三个班改办为航技科第三、四、五班。
这一时期，学校实行军事化管理。学生一律剪短发、佩领章、穿麻色三峡布衣裤、拴腰带、打绑腿、穿布鞋或草鞋，管教极为森严。又由于物资匮乏，条件艰苦，学业要求高，教师学生均承受着极大压力。然而，师生们都怀着一颗爱国之心，纵然万险千难，也要完成学业报效国家。对此，1945年毕业的航技三班学生留下的班史有真实感人的记述：始进校时，即逢以臭米为餐，恶气袭人，入口复哺，强食之亦难三咽……然而八时功课，四时自习，日不缺一，习实则锻工铁锤，木工斧锯，钳工钻锉，铸工翻型，手脑并用，精力其竭，以馁腹而临重任，非铜骨铁筋孰能不倦……皆有坚韧不拔之意志，百折不回之雄心，遇苦则苦干，值难则任难，虽困乏而自甘。
校长任寿彭对学校的境况和师生表现则概括为：“数年以来，时值非常，学校之困难万端，顾亦殊难究其责属谁归。幸我贤明之教师于破碎支离之生涯中，不倦训诲，而今日能获结业之诸生，亦尚能奋勉无懈，始克臻此。”
抗战八年，学校不仅办学从未中断，且规模日益扩大，专业得到拓展，质量明显提高，养成众多栋梁之材。据初略统计，八年中学校招生人数超过2000人，毕业700余人（1913至1949年招生约5000人，毕业约2000人）。以1943年为例，当年招生227人，毕业122人，在校生人数452人，其中教育部要求办的中技科学生264人，普通科学生188人。
随着抗战的胜利，无机校也在1946年4月，由多宝寺迁到茶店子（成都二十中校址）。然而，这里无论办公条件，还是交通都相对有些落伍，于是学校再次面临着未来发展的实际问题。
当成都进入新的历史时期，无机校也就顺理成章地被新政府接管，由川西人民行政公署文教厅管理，可谓揭开了新面纱。
1951年7月，无机校就迁到花牌坊街，此地址原来是私立立达学校的旧址。刚迁来的时候，全校面积仅20亩，实习工厂无处安排，就近暂住乡农市街208号。第二年9月，按照有关文件精神，无机校划归四川省工业厅管理。
从此，无机校在这里办公，虽然名字也偶有变化，但至此再也没有搬过地方了。